Pirx. Visualizar dados moleculares com esta ferramenta
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Pirx. Classificação e resumo

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Ver dados moleculares com esta ferramenta O PyRx é um aplicativo de triagem virtual fácil de usar especialmente para descoberta de drogas computacionais que podem ser usadas para criar bibliotecas de compostos contra alvos potenciais de drogas. A PyRx permite que os químicos medicinais executem a triagem virtual formem qualquer plataforma e ajude os usuários em todas as etapas deste processo - desde a preparação de dados até a submissão de trabalho e análise dos resultados. Embora seja verdade que não há botão mágico no processo de descoberta de drogas, o PyRx inclui assistente de encaixe com interface de usuário fácil de usar, o que o torna uma ferramenta valiosa para o desenho de drogas assistido por computador. A PyRx também inclui funcionalidade de planilha química e mecanismo de visualização poderoso que são essenciais para o projeto de medicamentos racionais. O que há de novo nesta versão: · Adicionado Salvar como ferramenta de valores separados por vírgulas (CSV) para tabelas de banco de dados. · Adicionado recurso de plotagem para tabelas de banco de dados. Esse recurso pode ser acessado através de um botão da barra de ferramentas na guia Tabelas. Por padrão, ele abre a caixa de diálogo Plotting da tabela, onde um enredo da barra de energia de ligação versus ligando (índice) é mostrado. Se você tiver um bioensaio do PUBCHEM abriu usando o botão Abrir CVS, este widget também verificará se há uma coluna de resultados nessa tabela e, em caso afirmativo, ele vai colorir barras correspondentes a compostos "ativos" vermelhos e barras correspondentes a "inativo" . · Campo de força padrão alterado para a minimização de energia de Babel aberta da UFF para MMFF94. · Alterado o padrão para o número máximo de avaliações de energia (parâmetro Generic Algoritmo em AutoDock) a partir de Médio (GA_NUM_EVALS = 2500000) para curta (GA_NUM_EVALS = 250000). · Adicionado Diálogo de Progresso da Submissão de Trabalho da AutoDock PBS. · Corrigido um bug que estava causando problemas ao exibir superfícies moleculares para conformações ancoradas. · Adicionado uma caixa de diálogo para selecionar a conformação alternativa ao fazer o arquivo Macromolecule (PDBQT) para AutoDock. · Ativado O agente de qualidade do entagado que pode ser usado para obter relatório de bug e comentários de um usuário. · Adicionado Cancelar opção para serviços da Web Autogrid. · Implementou resíduos flexíveis para o AutoDock. Esse recurso pode ser acessado selecionando Resíduos em Navigator-> Moléculas e clicando com o botão direito do mouse nelas. Selecione AutoDock -> Resíduos flexíveis para criar a pasta _flex em Navigator -> AutoDock -> Macromoléculas com o receptor PDBQT e Flex.pdbqt. Todos os encaixes para este receptor são então feitos com este (s) resíduo (s) flexível (s). · Python atualizado para a versão 2.6 e ETS para 3.4.0.

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