Peptídeos Interpretação de identificações proteômicas de vários mecanismos de pesquisa
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A PeptIDeshaker é um aplicativo gratuito e de código aberto que permite a visualização de resultados de identificação peptídica e proteína de vários mecanismos de pesquisa.Peptideshaker é dividido em oito abas que cobrem aspectos da análise: · Visão geral: Obter uma visão geral mas detalhada da proteína e péptido identificações com espectros anotados automaticamente e sequência de proteína anotada. · IDs do espectro: comparar o desempenho do mecanismo de pesquisa e veja como os resultados do mecanismo de pesquisa são combinados. · Frações: Inspecionar a partir das quais as proteínas de frações e peptídeos são susceptíveis de vir de. · Modificações: obter uma visão geral Das modificações pós-translacionais no conjunto de dados. · Estrutura 3D: mapear os péptidos e modificações detectadas nas correspondentes estruturas PDB. · Anotação: acesso simples a recursos de anotação para suas proteínas. · Vá enriquecimento: Encontre os termos enriquecidos em seu conjunto de dados. · Validação: Inspecionar e ajustar o processo de validação. · Gráficos QC: Obtenha uma visão geral da qualidade do seu resulta com parcelas de controle de qualidade. A PeptIDeshaker é cross-platform e funciona no Mac OS X, Windows e Linux. Binários para as plataformas Windows e Linux estão disponíveis na página inicial do projeto.

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