Midas sistema de análise de dados de microarray livre
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Sistema de análise de dados de microarray grátis O MicroArray Data Analysis System é um aplicativo Java grátis que fornece aos usuários uma interface intuitiva para projetar protocolos de análise combinando uma ou mais etapas de normalização e filtragem. Desta forma, os dados de muitas hibridizações individuais podem ser tratados de maneira uniforme e reprodutível. Midas lê arquivos ".tav" gerados pelo Spotfinder de TIGR ou recuperados do banco de dados via madame. Os módulos de normalização incluem regressão linear ponderada localmente (baixa; (Cleveland e Devlin, 1988; Yang et al., 2002)) e normalização total da intensidade. Estes podem ser vinculados a filtros, incluindo corte de baixa intensidade, cutffs de escore Z de intensidade - dependente de intensidade e replicar consistência de corte, criando um método altamente personalizável para preparar dados de expressão para comparação e análise subseqüentes. Os métodos de análise de dados são construídos usando uma linguagem de script gráfica intuitiva e podem ser salvas para aplicação a outros conjuntos de dados. Midas fornece dispersão que ilustram os efeitos de cada algoritmo nos dados. Quando as etapas de normalização e filtragem são concluídas, as Midas saíam dos dados no formato TAV. Requisitos: · Java 1.4.1 ou mais tarde

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