Maexplorer. Maexplorer - instalação de mineração de dados baseadas em Java para bancos de dados de microarray de cDNA ou oligonucleiotas
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Maexplorer. Classificação e resumo

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Minerador de dados gene cDNA. minerador de dados de cDNA. comparação de genes análise de genes

Maexplorer. Descrição

Maexplorer - Facilidade de mineração de dados baseada em Java para bancos de dados de microarray de cdna ou oligonucleiotas Maexplorer (MicroArray Explorer) é uma instalação de mineração de dados baseada em Java para bancos de dados de microarray de cDNA ou oligonucleiotas. Seu ambiente de análise de dados exploratórios fornece ferramentas para a mineração de dados de perfis de expressão quantitativa em vários microarrays.MicolarArray Os dados podem ser visualizados e diretamente manipulados em pseudoimages de matriz, gráficos de dispersão, histogramas, parcelas de perfil de expressão, análises de cluster (genes semelhantes, k-meios similares ou k-median, agrupamento hierárquico, etc.) e relatórios. Um recurso chave é os filtros de dados genéticos para restringir um conjunto de genes de trabalho para aqueles que passam uma variedade de testes e condições especificados pelo usuário. Os relatórios podem ser gerados com hipertexto acesso à Web a bancos de dados genômicos, como banco de dados Unigene, LocusLink, DBEST, NCI / Cit MyBRArray, imagem, genbank e outros bancos de dados da Internet para conjuntos de genes encontrados para serem de interesse. Um foco principal desta ferramenta. é a mineração de dados interativos com acesso a outros bancos de dados genômicos de suporte da Web. A ênfase na manipulação direta de genes e conjuntos de genes em gráficos e tabelas fornece um alto nível de interação com os dados que facilitam os investigadores para testar ideias ao procurar padrões. A API Java Open Maexplorer está disponível para criar seus próprios Java Maeitplugins . Isso permite que você adicione suas próprias ferramentas analíticas, bem como as criadas por outros pesquisadores para estender a funcionalidade do Maexplorer. Estes poderiam incluir adicionar novos métodos de análise ao sistema base, como testes estatísticos, normalização, cluster, servidor cliente, etc.here são alguns principais recursos de "Maexplorer": · Analisar a expressão de genes individuais; · Analise a expressão de famílias e clusters gênicos; · Compare padrões de expressão e outliers; · Acessar diretamente a outros bancos de dados genómicos para genes de interesse.Note: Maexplorer é liberado sob a Licença Pública Mozilla 1.1 (MPL 1.1).

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