Ligandscout. Aplicativo de software para modelagem avançada de farmacophore
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Ligandscout. Classificação e resumo

Ligandscout. Tag

Sobreposição molécula complexo molécula Geração de farmacoforeiro Sobreposição de farmacóforos farmacophore.

Ligandscout. Descrição

Aplicativo de software para modelagem avançada de farmacophore O LigandScout é uma ferramenta de software que permite rapidamente e transparentemente derivam farmacóforos 3D de dados estruturais de complexos de macromolécula / ligando em uma maneira totalmente automatizada e conveniente. Os algoritmos são cientificamente publicados e com base em vários anos de experiência em criação de farmacophore , enquanto o aplicativo corresponde a tecnologia de informação de última geração. Suporte para vários formatos de farmacóforos comuns como a exportação para Catalysttm, Moetm ou Phasetm garantem a máxima interoperabilidade para plataformas de triagem. A interface gráfica 3D completa com vários níveis de desfazer tornará a exploração do site ativo e criação de farmacoforário dentro do complexo transparente e eficiente. Análise de site de ligação, alinhamento baseado em farmacoforeiro e a criação de farmacóforos de característica compartilhada são projetados para tornar a ligandscout uma ferramenta essencial para o desenho de drogas à base de estrutura em combinação com a triagem virtual. Ligandscout é executado em todos os sistemas operacionais comuns. Interpretação automática de ligandos PDB usando geometria, dicionários e regras? Interface de usuário de última geração com gráficos 3D avançados e desfazer-fungem? Visualização 2D e visualização hierárquica diretamente ligada à interface 3D? Alinhamento rápido de moléculas em sua conformação bio-ativa para outras moléculas e farmacóforos 3D de vários ligandos e / ou farmacóforos, os farmacóficos compartilhados podem ser derivados para entender e modelar o modo de ação relevante? Manipulação avançada de co-fatores, íons, moléculas de água e ligandos covalentemente ligados? Exportação de farmacophore para catalisador (TM), MOE (TM) e Fase (TM) para triagem virtual? Extenso controle de parâmetros para usuários mais experientes? Avançado PDB Ligand Perception e fácil correção manual durante a modelagem no site ativo? Capacidade de tratar co-fatores e moléculas de água como parte do ligando ou parte da macromolécula? Alinhamento intuitivo baseado em farmacoforeiros de moléculas? Suporte para os formatos de arquivo mais comuns? Gerenciamento sofisticado de arquivos e repositórios de sites de ligação editados e armazenados, moléculas e farmacophoresRequirements :? pelo menos 512 MB de RAM (1 GB recomendado)? Java 1.5 Ambiente de tempo de execução? Cartão de gráficos 3D acelerados por hardware (NVIDIA ou ATI recomendado) com limitações de suporte OpenGL 1.2: · 30 dias de avaliação

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