| Lalnview. Ferramenta para visualizar os alinhamentos locais entre duas seqüências |
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Lalnview. Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Lalnview Team
- Site do editor:
- http://pbil.univ-lyon1.fr
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 351 KB
Lalnview. Tag
Lalnview. Descrição
Ferramenta para visualizar os alinhamentos locais entre duas seqüências A Lalnview é um programa gráfico gratuito e aberto para visualizar os alinhamentos locais entre duas seqüências (proteína ou ácidos nucleicos). As seqüências são representadas por retângulos coloridos para dar uma imagem geral das semelhanças entre as duas seqüências. Os blocos de similaridade entre as duas sequências são coloridos de acordo com o grau de identidade entre os segmentos.LalnVIEW também é capaz de exibir recursos de sequência (site ativo, domínio, motivo, propepeto, exon, intron, promotor, etc.), juntamente com o alinhamento. Isso permite tornar o link entre semelhança de seqüência e funções conhecidas. Ao usar o LALNVIEW através desses servidores, os recursos de sequência são extraídos automaticamente de anotações de banco de dados e exibidos com as seqüências de texto Alinhamento.Full são exibidas em uma janela secundária. Ao clicar em um bloco, o usuário pode visualizar o domínio de alinhamento local correspondente. O domínio pode ser repetido em uma seqüência, clicando iterativo em um bloco exibirá sucessivamente todos os blocos semelhantes que ocorrerem na outra seqüência.
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