Koriblast. fornece várias interfaces gráficas de usuário e ferramentas de análise para visualizar facilmente e explorar os resultados da explosão.
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Koriblast. Classificação e resumo

Koriblast. Tag

EXPLOSÃO consulta resultado analisar dados Motor de explosão resultado de consulta.

Koriblast. Descrição

Fornece várias interfaces de usuário e ferramentas de análise para ver facilmente e para explorar resultados do BLAST gráfica. KoriBlast é um ambiente gráfico fiável dedicado para extracção de dados de sequência. KoriBlast combina pesquisas BLAST com capacidades de gestão avançada de dados e uma interface gráfica state-of-the-art. KoriBlast propõe um programador BLAST gráfica capaz de comparar as várias seqüências de consulta mesmo tempo contra vários bancos de dados de seqüência usando uma rede ou um motor de BLAST local. KoriBlast fornece várias interfaces de usuário e ferramentas de análise gráfica facilmente visualizar e explorar resultados do BLAST de maneira significativa, facilitando a interpretação dos dados. Além disso, KoriBlast é capaz de recuperar automaticamente dados de bancos de dados NCBI Entrez, integrando informações valiosas diretamente nos relatórios BLAST gráficas. Finalmente, todas as informações disponíveis a partir KoriBlast podem ser consultados que lhe permite localizar rapidamente informações relevantes, reduzindo a quantidade de dados a analyse.Note: Para fazer o download e receber uma chave de licença que lhe permitirá executar o aplicativo, você deve se registrar. Aqui estão algumas características-chave de "KoriBlast": · Um amigável e fácil de aprender software gráfico. · A BLAST programador para executar a busca com várias seqüências de consulta contra vários bancos de dados ao mesmo tempo. · Consultas BLAST são executados utilizando o servidor NCBI BLAST ou uma instalação local do BLAST. · Inteligentemente integrada ferramentas de análise de gráficos fornecendo um sistema de mineração BLAST muito eficiente. · Importar dados adicionais (hits conhecidos recursos) por um acesso direto e transparente para as fontes de dados biológicos. · Os dados importados são: integrados nos resultados do BLAST, exibido dentro relatórios gráficos, disponíveis para resultados do BLAST filtro. · Localizar informações usando filtros relevantes. · Reduzir a quantidade de dados para analisar o uso de filtros. · Os dados armazenado no disco rígido do usuário permanecem disponíveis ao longo do tempo. · Exportar dados para aplicativos de planilha. · Recuperar seqüências de golpes cheios de bancos de dados de seqüência remotos. · Exportação seqüências de sucesso completo para arquivos de FASTA. · Re-BLAST consultas BLAST anteriores com um único clique do mouse. · Re-BLAST sequências de golpes completos com um único clique do mouse. · Plena exibição entradas de sucesso usando o seu navegador Web favorito. Requisitos: · PowerPC (G3 ou mais recente) ou processador Intel Pentium. · A Java Virtual Machine (JVM) 1.5.0 ou superior. · Pelo menos 128 Mo de RAM (256 Mo recomendado). · A resolução de tela de 1024 por 728 pixels. Limitações: · 14 dias período de teste. O que há de novo nesta versão: · Pesquisas PSI-BLAST estão disponíveis a partir do módulo de pesquisa e o Analisar Módulo foi adaptado para permitir a análise estendida dos resultados (ver figura abaixo, e visualizar este vídeo). · Preparar bancos de dados explosão pessoais de GenBank nativa, Genpept, EMBL, SwissProt e arquivos UniProt, utilizando texto simples ou compactado arquivos compactados (ver este vídeo). · Instalar pré-formatado NCBI Explosão bancos de dados diretamente de seus arquivos nativos 'tar.gz' (ver este vídeo). · Filtros Projeto de busca que permitem a correspondência de padrões em sequências de sucesso. · Comparar os resultados de busca para encontrar novo, comum ou sucessos excluídos. · Arquivos e filtros de dados Export KoriBlast para compartilhar com colegas, tendo KoriBlast ou BlastViewer. · New Sequence Viewer para mostrar e manipular seqüências (extrato, traduzir, obter composições) baixados de repositórios públicos (ver figura abaixo). · Melhor manipulação de grandes projetos envolvendo milhares de seqüências.

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