KingRoup Um programa para a reconstrução do relacionamento de pedigree e as atribuições do grupo Kin usando marcadores genéticos
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Um Programa para Reconstrução de Relacionamento Pedigree e Atribuições de Grupo Kin usando marcadores genéticos A estimativa de frequências populacionais de marcadores genéticos codominantes de amostras com estruturas de parâmetros desconhecidos é de suma importância para os estudos genéticos da população, uma vez que formam a base para análises genéticas a jusante. As freqüências podem ser usadas para estimar, por exemplo, a distância genética entre duas populações, ou o tamanho efetivo da população. Da mesma forma, os desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg (HWE) desses alelos podem ser usados para avaliar os efeitos passados na estrutura genética da população devido, por exemplo, deriva genética, endogam e gargalos genéticos. As frequências populacionais são normalmente estimadas de uma grande amostra de indivíduos não relacionados. Na prática, pode ser difícil adquirir genótipos de indivíduos livres que preencham essa suposição básica de freqüências populacionais de amostragem e muitas vezes as amostras contêm uma mistura de genótipos relacionados Várias gerações.Currentemente, é desconhecido como a população alelo freqüências pode ser estimada de forma confiável quando os pedigrees reais dentro dos conjuntos de dados são desconhecidos e devem ser avaliados simultaneamente. Embora isso possa não importar para grandes tamanhos de amostragem dentro de uma população aleatoriamente da interbreação, onde todos os indivíduos contribuem igualmente para a próxima geração, isso certamente importará para pequenas amostras de populações em que alguns indivíduos são mais produtivos do que outros.Considering isso, o programa KingRoup visa Para oferecer-lhe uma ferramenta simples e prática para estudar visualmente a forma como o trabalho de reconstrução de relacionamento pedigree. Requisitos: · Java.

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