Imas. um sistema livre para a descoberta de conhecimento em informações genômicas
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Imas. Classificação e resumo

Imas. Tag

analisar descobrir Genoma analisar genoma Analytics visual Descoberta do genoma

Imas. Descrição

Um sistema livre para a descoberta de conhecimento em informações genômicas Imas (o sistema interativo de análise multigenômico) é um sistema gratuito e aberto de código aberto para a descoberta de conhecimento em informações genômicas. A IMAS permite que os cientistas genômicos analisem rapidamente um conjunto de sequências genômicas microbianas usando ferramentas como vislumbre, explosão, clustalw, primer3 e transferência e para visualizar a saída dessas ferramentas em uma estrutura genômica unificada.Imas fornece ao usuário um zoom dimensional interface gráfica para uma sequência genômica. O usuário pode interagir com a sequência para analisar a presença de regiões de codificação, que podem ser analisadas por alinhamento de seqüência com bancos de dados locais e remotos usando a explosão. Os resultados da explosão são exibidos em uma estrutura gráfica unificada que permite ao usuário filtrar e selecionar hits de exclusão de juros. Os hits de explosão selecionados podem ser então multializados usando Clustalw, e essas multiplicativas são exibidas usando a estrutura gráfica comum. Multialimações e alinhamentos de pares podem ser anotados pelo usuário para referência futura e relatórios HTML podem ser gerados mostrando essas descobertas.

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