Goaxexplorer.
Baixe Agora

Goaxexplorer. Classificação e resumo

Goaxexplorer. Tag

comparar Genoma Taxonomia Comparação do genoma. genômica comparativa Classificação taxonômica

Goaxexplorer. Descrição

Permite que você faça uma classificação taxonômica O GoTaxexplorer é um software gratuito e fácil de usar, que apresenta uma nova abordagem para genômica comparativa que integra informações funcionais e famílias com a classificação taxonômica.Gotaxexplorer integra Uniprot, Gene Ontology, Taxonomia do NCBI, PFAM e Smart em um banco de dados. GOTAXEXPLORER Fornece quatro tipos de consulta diferentes: · Seleção de conjuntos · Comparação de conjuntos de famílias de PFAM · Comparação semântica de conjuntos de termos · Comparação funcional de conjuntos de produtos genesThis permite selecionar conjuntos personalizados de termos, famílias ou grupos taxonômicos personalizados. Por exemplo, é possível comparar organismos ou grupos de organismos selecionados arbitrariamente da árvore taxonômica com base na funcionalidade de seus genes. Além disso, a GoTaxexplorer permite determinar a distribuição de funções moleculares específicas ou famílias proteicas na taxonomia. A comparação de conjuntos de termos de go permite avaliar a semelhança semântica de dois termos diferentes. A comparação funcional dos produtos genéticos permite identificar produtos genéticos funcionalmente equivalentes e funcionalmente relacionados de dois organismos com base em anotações e uma medida de similaridade semântica para ir. Este método é independente da semelhança de seqüência e, portanto, capaz de encontrar proteínas funcionalmente equivalentes ou funcionalmente relacionadas que não são homólogas. Requisitos: · Java 1.6 ou mais tarde

Goaxexplorer. Software Relacionado