Gnw. Ferramenta Java para gerar realistas em benchmarks silico para algoritmos de rede genética
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Gnw. Classificação e resumo

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Gnw. Descrição

Ferramenta Java para gerar realistas em benchmarks Silico para algoritmos de rede genética Genenetweaver (GNW) é uma ferramenta Java fácil de usar para gerar realistas em benchmarks de silico para algoritmos de engenharia reversa da rede genética. O GNW foi usado para gerar o Dream3 em desafios silico. É conhecido que o desempenho dos métodos de engenharia reversa pode ser muito sensível ao tipo de estrutura de rede que são aplicados (por exemplo, um método pode executar bem nas redes ERDÖS-Rény e falhar em redes livres de escala). Assim, para uma comparação justa de métodos, é crucial que as redes de referência tenham uma estrutura realista.Enstead de usar modelos de gráfico aleatório, que são conhecidos apenas parcialmente as propriedades estruturais das redes biológicas, geramos estruturas de rede, extraindo módulos de módulos redes de interação biológica. Na Ref. Depois de gerar estruturas de rede realistas, a próxima pergunta é como gerar dados realistas dessas redes usando modelos dinâmicos adequados. No anterior em benchmarks do Silico (por exemplo, Mendes et al.), Modelos fenomenológicos relativamente simples foram utilizados para este fim. Requisitos: · Java.

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