Findpeaks. executa análise em experimentos de chip-seq
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Findpeaks. Classificação e resumo

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Findpeaks. Descrição

Executa a análise em experimentos de chip-seq Findpeaks é um software gratuito desenvolvido para realizar análises de experimentos de chip-seq. A Findpeaks usa um algoritmo ingênuo para identificar regiões de alta cobertura, que representam o enriquecimento de imunoprecipitação de cromatina de fragmentos de sequência, indicando a localização de uma proteína de interesse vinculada. Um limite mínimo de altura é usado para determinar quais "picos" são mostrados no arquivo WIG compatível com UCSC - se nenhum limite for usado, todas as leituras serão mostradas. A Findpeaks recolhe e classifica as leituras ao longo de cada cromossomos e identifica áreas de enriquecimento, denominadas "picos". Esses picos são particularmente importantes em experimentos de imunoprecipação de cromatina (experimentos chip-seq ou chip-solexa), como indicam a localização de uma proteína de interesse vinculada. Requisitos: · Java. O que há de novo nesta versão: · Bugfix: valores de FDR normalizados

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