Ever-seq. Uma ferramenta que fornece controle de qualidade sobre conjuntos de dados RNA-SEQ
Baixe Agora

Ever-seq. Classificação e resumo

Ever-seq. Tag

ana transcriptoma.

Ever-seq. Descrição

O sequenciamento transcriptório profundo (RNA-SEQ) fornece informações maciças e valiosas sobre elementos funcionais no genoma. Usando dados de RNA-SEQ, as pessoas podem fazer a mudança de expressão gênica, interrogar eventos em splicing alternativos, descobrir novas regiões transcritas, detectar transcrições aberrantes (como fusões genéticas) e variantes de codificação, etc. Idealmente, o sequenciamento transcriptoma deve ser capaz de identificar e quantificar diretamente todas as espécies de RNA, pequena ou grande, baixa ou alta abundância. No entanto, o RNA-SEQ é um processo complicado, multissep envolvendo a preparação da amostra, amplificação, fragmentação, purificação e sequenciamento. Uma única operação inadequada resultaria em dados tendenciosos ou até mesmo inutilizáveis. Portanto, é sempre uma boa prática verificar a qualidade de seus dados do RNA-SEQ antes de buscar quaisquer direções listadas acima. O Ever-SEQ é um pacote gratuito e aberto (avalie o experimento de RNA-SEQ) para conjuntos de dados de RNA-SEQ de controle de qualidade abrangente. O Ever-SEQ é a plataforma cruzada e funciona no Mac OS X, Windows e Linux.Detailed As instruções sobre como instalar e usar o utilitário Ever-SEQ em seu Mac estão disponíveis aqui.

Ever-seq. Software Relacionado