| Epos Uma estrutura de software modular para análise e visualização filogenética. |
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Epos Classificação e resumo
- Nome do editor:
- University of Jena
- Site do editor:
- http://bio.informatik.uni-jena.de/epos/
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X 10.4 or later
- Tamanho do arquivo:
- 14.2 MB
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Epos Descrição
Uma estrutura de software modular para análise e visualização filogenética. Apresentamos EPOS, uma estrutura de software modular para análise e visualização filogenética. O software filogenético existente pode ser dividido em dois grupos. Pacotes algorítmicos que fornecem métodos computacionais para um problema específico e ferramentas de visualização para analisar os resultados. Muitas ferramentas algorítmicas não têm a usabilidade, pois elas costumam ser baseadas em linha, enquanto as visualizações muitas vezes sofrem de interfaces de usuário gráficas ruins. A EPOS preenche essa lacuna combinando uma poderosa interface gráfica do usuário com um sistema de plug-in que permite a integração simples de novos algoritmos, visualizações e estruturas de dados. Uma interface consistente é usada para gerenciar dados ou iniciar os métodos computacionais disponíveis, desconectando o fluxo de trabalho dos dados ou métodos aplicados. Atualmente, a EPOS fornece algoritmos para reconstrução de árvores baseadas na distância, distâncias de árvores, árvores consensuais e métodos de supertree. Todos os métodos são integrados em um sistema de pipeline que permite combinações de métodos executados sequencialmente, onde o fluxo de dados é tratado automaticamente pelo sistema. Uma visão de árvore abrangente está incluída nos EPOS. Ele oferece layouts, coloração, anotação e funções de exportação e é capaz de render suavemente as árvores até algumas mil folhas. À medida que as visualizações fazem parte do sistema modular, elas podem ser estendidas em qualquer direção e novos módulos de visualização podem ser integrados a manipular, digamos, redes filogenéticas. Para simplificar o manuseio de dados, a EPOS permite que o usuário crie um espaço de trabalho persistente que contenha todos os conjuntos de dados usados. A informação dentro do espaço de trabalho é persistentemente armazenada em um módulo de back-end extensível e transparente.Requirements: · 256MB, melhor 512MB de Ram grátis O que há de novo nesta versão: · Não contém novos recursos, mas corrige alguns dos bugs mais anoying, incluindo o problema "Não use o seu caminho de instalação".
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