Edição de via de bibliosphere Bibliosphere Pathway Edition - oferece uma combinação única de análise de mineração e via de literatura para biólogos moleculares
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Bibliosphere Pathway Edition - oferece uma combinação única de literatura e análise de caminhos para biólogos moleculares A BIBliosphere oferece uma combinação única de análise de mineração de literatura e viagens para biólogos moleculares interessados em regulamentação genética e redes biológicas.Bibliosphere usa um banco de dados abrangente de relacionamentos modelados individualmente entre genes, proteínas, complexos, células e tecidos em conjunto com texto atualizado Técnicas de mineração para a extração automatizada de conhecimento para permitir que você vincule seus dados a redes biológicas em diferentes contextos biológicos. Este recurso Bibliosphere resulta de várias linhas de evidência que estão incluídas na sua base de dados. Aqui estão algumas características importantes do "Kibliosphere Analysis Kit": estender as redes biológicas para além das informações do caminho canônico (metabólicas e regulamentares) · Mesclar sua alta taxa de transferência, conhecimento e análises baseadas genômicas · Realizar análise de viagens regulamentares sensíveis ao contexto · Gerar variações de caminho específicas de experimento · Vinculações para os mecanismos e genes da doença · Faça avançado Design Experimental · Caminho BibliosphereEdition O FFers um conceito único devido a ... · Integração de bancos de dados de literatura, genómica, interação, camada e rede · Relacionamentos genéticos baseados em análise de literatura atualizado · Múltiplas classificações de ontologia · Dados curados especializados sobre Regulamento genético · Atribuição de genes a vias (regulamentação e metabólica) · Network sofisticado e algoritmos de layout 3D · Algoritmos para encontrar vias ideais (algoritmos de caminho mais curtos) · Links para vários recursos de conhecimento (por exemplo, Ir, malha, bindrequirements: · Java 1.5.0_06 ou superior. · Conexão à Internet · 512 MB Memória principal O que há de novo nesta versão: · Filtro de texto gratuito: permite restringir a rede a genes que são citados na literatura em conjunto com um termo definido pelo usuário · Filtro de co-citação: permite restringir a rede de acordo com · Regras sintáticas das co-citações, · Número de co-citações, · Grau de interconexão entre genes. Filtro biológico: permite restringir a rede a genes que são atribuídos à mesma classe biológica. As aulas são definidas por: · Ontologia genética · Função molecular. · Função biológica. · Componente celular. · Termos de malha · Produtos químicos e drogas · Anatomia · Doença · Ciências Biológicas · Técnicas analíticas, diagnósticas e terapêuticas e tecidos de equipamentos · Filtro exclusivo para reguladores genéticos (fatores de transcrição de genes de entrada) verificados automaticamente no nível de sequência. · O Caminho Bibliosphere fornece análise estatística de todas as redes visíveis em relação a classes genéticas super-representadas e subterrâneas. A análise estatística é calculada pela pontuação z. · Bibliosphere PathwayEdition oferece funcionalidade integrada da análise estatística e filtragem: um único clique filtrica uma rede para esses genes que são super-representados de acordo com a classe Go ou de malha. · A construção de rede / caminho da regime de bibliosphere é dinâmica e puramente impulsionada por dados. · Outros sistemas calcular uma rede priori com max. 35 nós, deixando você no escuro sobre como essas redes foram derivadas.

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