| Dang permite ler arquivos PDB e gerar uma tabela para cada resíduo ou base |
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Dang Classificação e resumo
- Nome do editor:
- J Michael Word
- Site do editor:
- http://kinemage.biochem.duke.edu/
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 109 KB
Dang Tag
Dang Descrição
Permite ler arquivos PDB e gerar uma tabela para cada resíduo ou base Dang é um programa gratuito e simples do UNIX C ++ criado para ler um arquivo de coordenadas da estrutura molecular de um banco de dados de proteína (PDB) e gera uma tabela de várias medidas geométricas úteis para cada resíduo ou base. Em sua forma mais básica, Dang escreve os ângulos diédricos (Phi, Psi, Chi #), portanto, então " Dang também identifica ligações dissulfureto. Para ácidos nucleicos, o ângulo de pseudo-rotação é gerado. A saída é formada para fácil análise por AWK, Grep, Classificar e outros utilitários UNIX. A bandeira - Extra adicionará Tau, Omega, Max B, Min EXC, CA Pseudo-Dihedral, CA-CA Distance.scripts para analisar a saída Dang em tabelas delimitadas estão disponíveis aqui.
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