| DEGRAUS pacote para simulação estocástica exata de sistemas de difusão de reação |
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DEGRAUS Classificação e resumo
- Nome do editor:
- STEPS Team
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 1.4 MB
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Pacote para simulação estocástica exata de sistemas de difusão de reação As etapas é um pacote de código livre gratuito e aberto para simulação estocástica exata de sistemas de difusão de reação em geometrias 3D arbitrariamente complexas. O algoritmo de simulação central é uma implementação da SSA de Gillespie, estendida para lidar com a difusão de moléculas sobre os elementos de uma malha tetraédrica 3D.Enquanto os degraus foram desenvolvidos principalmente para simular modelos detalhados de vias de sinalização neuronal em dendrites e em torno de sinapses, é também um ferramenta e pode ser usado para estudar qualquer via bioquímica na qual os gradientes espaciais e a morfologia são pensados para desempenhar um papel. Requisitos: · Python 2.5 ou posterior
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