Compucell 3D. Modeling Environment e PDE Solver
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Compucell 3D. Classificação e resumo

Compucell 3D. Tag

simular simulação Solver PDE. Ambiente de modelagem Simulação celular celular

Compucell 3D. Descrição

Ambiente de Modelagem e solver PDE CompuCell 3D é um ambiente de modelagem fonte aberto e solucionador de PDE, primariamente usadas para estudar o comportamento celular. CompuCell foi inicialmente desenvolvido para ajudar os investigadores (biólogos e físicos) Materiais de modelo e tecidos sem a necessidade de recursos dedicar ao desenvolvimento de código que irá reproduzir software existente. O código é construída em C ++ com um invólucro Python. Os usuários podem facilmente definir parâmetros do modelo em um arquivo XML e executar a simulação com a nossa GUI, o jogador CompuCell. CompuCell 3D oferece uma interface fácil de modelos complexos, bem como a visualização em tempo real de suas simulações. Requisitos: · Python 2.5 ou posterior O que há de novo nesta versão: · Novo, redesenhado CompuCell jogador com a capacidade de condução, capacidade de · Repetição previamente salvos resultados da simulação, melhores gráficos renderização usando VTK · E muitas outras melhorias. Introduzido capacidade de adicionar novos tipos de user- · Definido e campos controlados pelo usuário que podem ser prestados no novo jogador. · Para MacOS que distribuímos pequeno, mas útil aplicação escrito por David Larson · Que permite aos usuários pixelize fotos experimentais e convertê-los em PIF · Arquivos de inicialização. Os usuários simplesmente "pintar" a imagem experimental e celular Atribuir · Tipos para as regiões pintadas. · Experimental Adicionado, módulos externos que resolvem modelos de redes subcelulares · Escrito em SBML. Este recurso ainda está na versão beta, mas parece integrar · Com CC3D muito bem. Vamos atualizar os usuários sobre o nosso progresso a este respeito. · Capacidade de simulações de execução em um modo silencioso (sem usar Player). Os resultados são · Armazenados no formato VTK e pode ser pós-processados usando CompuCell · Player ou scripts personalizados escritos. · Renomeado Plasticidade a elasticidade. Todas as simulações escritos para a versão CC3D · Anterior para atual e utilizando plugins Plasticidade deve ser atualizado e mudança · Palavra "plasticidade" a "elasticidade". Esta convenção de nomenclatura corresponde melhor às · O que esses plugins implementar. · Estrutura de diretório do código fonte Reestruturado · Nova solver reação-difusão que permite que os usuários especifiquem termos personalizados e · Não requer recompilação · Funcionalidade atualizada para plugins elasticidade, ContactLocalProduct plugin, · Numerosas correções de bugs

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