Cluego. Um plug-in de citsocape que visualiza os termos biológicos não redundantes para grandes aglomerados de genes
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Cluego. Classificação e resumo

Cluego. Tag

exibição visualizar gene plug-in de cytoscape visualize genes cluster de genes

Cluego. Descrição

Um plug-in de citoscape que visualiza os termos biológicos não redundantes para grandes grupos de genes O Cluego estuda os aglomerados de genes em uma rede funcionalmente agrupada e pode ser usado em combinação com golorizar. Os identificadores podem ser carregados de um arquivo de texto ou interativamente a partir de uma rede de citsocape. O tipo de identificadores suportados pode ser extremamente estendido pelo usuário. A Cluego realiza uma análise de cluster simples e comparação de clusters. Das fontes de ontologia usadas, os termos são selecionados por diferentes critérios de filtro. Os termos relacionados que compartilham genes associados semelhantes podem ser fundidos para reduzir a redundância. A rede Clugo é criada com estatísticas Kappa e reflete as relações entre os termos com base na semelhança de seus genes associados. Na rede, a cor do nó pode ser alternada entre grupos funcionais e distribuição de clusters. Os gráficos de Clugues estão subjacentes à especificidade e dos aspectos comuns do papel biológico. O significado dos termos e grupos é calculado automaticamente. Cluego é fácil atualizável com os arquivos mais recentes dos requisitos de ontologia do gene: · Java.

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