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Chea. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Freeware
  • Nome do editor:
  • CHEA Team
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X
  • Tamanho do arquivo:
  • 1.3 MB

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Chea. Descrição

Software para detectar fatores de transcrição enriquecidos para um conjunto de genes O CHEA é uma ferramenta de software gratuita e fácil de usar com banco de dados que pode ser usado para detectar fatores de transcrição enriquecidos para um conjunto de genes. No primeiro passo, todos os genes que não são alvos de qualquer fator de transcrição são removidos da lista de entrada. A análise a seguir é, portanto, realizada apenas nos genes restantes que são alvos de TF potenciais (isso inclui o cálculo das frações, consulte a seção C, 5.). Para cada TF, um conjunto de genes é atribuído que seja um subconjunto de seus alvos no banco de dados de segundo plano. Ao usar o teste exato de Fisher, um valor P é calculado que mede a significância de cada TF para a lista de entrada. Essa abordagem detecta o desvio do banco de dados de segundo plano e da lista de genes de entrada. Requisitos: · Java 1.6 ou mais tarde


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