Cese cese - ambiente integrado para realizar simulações computacionais usando uma variedade de modelos eletrofisiológicos
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CESSE - Ambiente integrado para realizar simulações computacionais usando uma variedade de modelos eletrofisiológicos CESSE (Cell Electrophysiology Simulation Ambiente) é uma estrutura abrangente projetada especificamente para realizar simulações eletrofisiológicas computacionais, por exemplo, simulações de atividade elétrica do miocito cardíaco. É útil para simulações de potenciais de ação, correntes iônicas individuais e mudanças nas concentrações iônicas.Cese é um programa de plataforma cruzada e ele será executado em qualquer sistema que tenha o Java Runtime Environment (JRE) versão 1.5 (5.0) ou superior. Foi testado em MacOS X, Windows, Linux, Solaris e Aix.cese é um ambiente integrado para realizar simulações computacionais usando uma variedade de modelos eletrofisiológicos. Essa fase cese permite a criação e a execução dos modelos de células únicas (contendo tanto Hodgkin -Huxley (HH) e formulações atuais markovianas). Modelos de atividade elétrica de miócitos cardíacos com código fonte estão incluídos na distribuição de cese. Esperamos estender o número de modelos disponíveis e adicionar certos modelos neuronais no futuro. A principal força da CESE está em sua uniformidade - uma interface de programa permanece a mesma para diferentes tipos de modelos. Você pode alternar facilmente entre os modelos e comparar as saídas de simulação. Os parâmetros do modelo podem ser modificados, selecionados para saída e / ou preso da mesma forma, o Way Standard. Concese estende o significado eletrofisiológico convencional da "braçadeira de tensão". Você pode gravar praticamente qualquer variável modelo, incluindo tensão (potencial de membrana), correntes iônicas totais ou individuais, concentrações iônicas, temperatura, variáveis de porta-gating, etc. Os comandos de fixação podem ser funções complexas de peças, definidas individualmente para a variável modelo de interesse . Isso abre infinitas possibilidades para a exploração do comportamento modelo complexo.Cese fornece visualizações de dados simples, mas eficientes. Os resultados da simulação podem ser apresentados nos formulários gráficos e tabulados. As parcelas podem ser personalizadas e regiões de interesse zoom. Embora a CESE não tenha sido projetada para ser uma ferramenta de análise de dados, você pode gerar relações de tensão de corrente (I-vs) e calcular parâmetros estatísticos para um determinado sinal dentro do programa. Você pode exportar seus dados para ASCII, AXON Text File (ATF) e formatos NetCDF para continuar a análise em seu pacote favorito. O que há de novo nesta versão: · Adicionado GUI para alterar os tipos de plotagem. 4 tipos de plotagem estão disponíveis: linha, símbolo, histograma e coluna. Edição . (Sm) · Adicionado tela de boas-vindas (atualmente configurado para a pesquisa da CESE). (Sm) · Impressão vazia fixa sob certas condições. (Sm) · Ação de registro de bloqueio fixo não ficando bloqueado. (Sm) · Melhor desempenho na lenda da trama. (Sm) · Alterou o local do diretório padrão para "Meus documentos / cese-1.4" no Windows. (Sm)

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