Ccdeep. análise profunda de conformação de cromatina
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Ccdeep. Classificação e resumo

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analisar conformação

Ccdeep. Descrição

A ferramenta Profundo da Conformação de Cromatina (CCDEEP) permite analisar os dados de sequenciamento de conformação de cromatina de experimentos Hi-C. O CCDEEP pode processar os dados com base em vários fatores: · Filtra as sequências com baixa qualidade, com base em seu mapeamento distante do local da enzima de restrição selecionada ou sua anexação a regiões com baixa mapaspabilidade · Produz uma enumeração e quantificação (cru e normalizada) de pares de extremidades do fragmento · Resume a visualização da quantificação tendenciosa (conteúdo GC, comprimento do fragmento e mapaspabilidades) Instruções detalhadas sobre como instalar e usar o utilitário CCDEEP em seu Mac estão disponíveis aqui. CCDEEP é cross-platform e funciona no Mac OS X e no Linux. Binários para a plataforma Linux estão disponíveis na página inicial do projeto.

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