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Programa BioInformatics para Análise de Sequência de Proteína e ADN avançada. Suas 2 x 2 semanas de demonstração totalmente funcional do CLC Main Workbench agrega todas as análises de seqüência de DNA da CLC Gene Workbench e todas as análises de seqüência de proteína da CLC Protein Workbench.clc Main Workbench é uma ferramenta que integra todas as análises em um único, amigável ao usuário, e aplicação de software intuitiva. Aqui estão algumas características principais da "CLC Main Workbench": · Montagem de dados de sequenciamento de DNA. · Projeto avançado de primer. · Clonagem molecular. · Anotação automática do SNP de sequências. · Previsão de estrutura de proteína secundária. · Vista molecular 3D integrada. · Predição de peptídeos de sinal (sinalp). · Previsão de hélice Transmembrana (TMHMM). · Análise da família Proteína (PFAM). · 2 tipos de alinhamentos. · Filogenética. · Pesquisa de motivo (padrões conhecidos). · Descoberta padrão (padrões desconhecidos). · EXPLOSÃO. · Processamento em lote de várias análises em um passo de trabalho. · Pontos de pontos. · Análises de hidrofobicidade. · Análises de antigenicidade. · Pesquisas no Genbank, SwissProt, Trembl e PubMed. · Registro detalhado de ações / análises realizadas. Requisitos: · RAM de 256 MB necessária. 512 MB de RAM recomendado. · 1024 x 768 Exibição recomendada. Limitações: · 4 semanas Período de avaliação totalmente funcional. O que há de novo nesta versão: Análise de expressão: · Terrenos do vulcão: Agora você pode escolher os valores para traçar o eixo X. Escolha entre "diferença" e "Dobre a mudança". Consulte Mais informação... · A visualização de tabelas das parcelas de bar mostra os mesmos intervalos que são mostrados na parcela da barra. · Importador genérico para dados de matriz de expressão em formato tabular. Consulte Mais informação... · Importador genérico para dados de anotação Expression Expression em formato tabular. Consulte Mais informação... · Arquivos Gene Ontology (GO) agora podem ser usados para anotar um experimento de expressão. Consulte Mais informação... · Profiling de tag: Você não está mais permissão para anotar amostras de tags, apenas experimentos · Painel lateral da tabela de experimentos foi reordenada para fornecer melhor visão geral. Consulte Mais informação... · Abrir a sequência de consenso, incluindo lacunas também colocará NS antes que a sequência consensual seja iniciada e depois termina Desdobramento, desenvolvimento: · Você pode definir um caminho para o local de dados padrão usado quando a bancada de trabalho começar pela primeira vez. Este é um recurso para ajudar os administradores do sistema a controlar onde novas instalações por padrão salve seus dados. Consulte Mais informação... · Suporte para remover ferramentas acessando a Internet (BLAST NCBI, notificações de atualização etc). Consulte Mais informação... Importação e Exportação Geral: · Suporte para importação de regiões complexas de arquivos GFF · Exportar tabelas e relatórios no formato do Excel. · Seção de importação do manual do usuário reestruturada para fornecer melhor visão geral. Leia mais .... Os importadores de dados de expressão agora são descritos em detalhes técnicos em uma seção separada. Consulte Mais informação.... · Você pode agora exportar várias listas de seqüência no formato FASTA · Importação forçada de arquivos ZIP agora é suportada (ele forçará a importar o conteúdo do arquivo zip) · A importação padrão agora aceita arquivos GZIP e TAR, bem como Zip · Se uma importação forçada falhar, haverá informações mais técnicas sobre o que deu errado, permitindo identificar a má formatação dos arquivos de importação · Tanto o genbank e o importador GFF agora fazem várias tentativas de nomear genes que não têm um nome genético. Iterativamente tentar os seguintes qualificadores: "produto", "locus_tag", "protein_id" e "transcript_id" · Ao importar arquivos Genbank, onde o comprimento declarado não corresponde à seqüência real, um aviso é mostrado, mas a sequência é aceita. · Ao exportar no formato CSV, as configurações de localidade são usadas para determinar se vírgulas ou semi-colons devem ser usadas como delimitador (vírgula usada para localidades dos EUA) · Plug-in do GFF foi atualizado para aceitar anotações complexas Diversos: · Retipagem avançada de anotações usando a tabela de anotação. Consulte Mais informação... · Melhor relatório de situações em que um disco completo impede a economia de dados · O download de seqüências usando arrastar e soltar da tabela de pesquisa não cria mais um nó "download ..." na pasta. O processo de download pode ser monitorado na guia Processos. · O projeto de primer agora suporta fragmentos de PCR por mais de 5000 pb. · Extrair sequências movidas do arquivo manu para caixa de ferramentas -> análise de seqüência geral. Consulte Mais informação... · Melhor feedback de progresso em vários diálogos Correções de bugs: · Problema fixo exibindo o rótulo "Copiando ..." ao copiar dados e atualizando a pasta · Problema fixo com a nomeação de guias. A correção significa que, no Windows e no Linux, os dados não salvos agora recebem um * em vez de fazer o nome da tabulação em negrito e itálico. (Isso sempre foi o comportamento no Mac OS X).

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