CLC BioInformatics Cube.

CLC Bioinformatics Cube executa Smith Waterman até 125 vezes mais rápido que um computador de mesa de 3 GHz
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CLC BioInformatics Cube. Classificação e resumo

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  • CLC bio
  • Site do editor:
  • http://www.clcbio.com
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  • MAC OS X 10.4 or later
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CLC BioInformatics Cube. Tag


CLC BioInformatics Cube. Descrição

CLC BioInformatics Cube administra Smith Waterman até 125 vezes mais rápido que um computador de mesa de 3 GHz Através do uso inovador da tecnologia FPGA, criamos um cubo que administra o Smith Waterman até 125 vezes mais rápido que um computador desktop de 3 GHz e aceite-se aceite a velocidade de explosão. As buscas de Smith Waterman tomam 14 horas na área de trabalho são, portanto, reduzidas a cerca de 7 minutos no cubo. Este é um avanço para a bioinformática baseada em desktop, pois dá aos pesquisadores a possibilidade de executar buscas de uma qualidade significativamente maior do que antes. Nossa comparação entre a explosão e o Smith Waterman mostram que a Running Blastp com o valor de expectativa padrão de 10 freqüentemente resulta em apenas metade do que muitos hits como executando uma pesquisa de Smith Waterman no Cube. Além disso, usando o cubo em vez de explosão, você poderá melhorar a qualidade dos dados que você está trabalhando! Aqui estão algumas características importantes do "CLC Bioinformatics Cube": · Esta abordagem inovadora para hardware baseado em FPGA A BioInformatics acelerada fornece flexibilidade em uma variedade de maneiras: · Local físico: Não há necessidade de uma sala de servidor refrigerada. Tudo que você precisa é de um pequeno quarto em sua mesa. · Sistema operacional: Conecte-se a qualquer tipo de computador através da porta USB, se ele está executando o Mac OS X, o Linux ou o Windows. · Uso do software: O Cubo Bioinformatics pode ser usado como Uma parte integrada de todas as bancadas de trabalho do CLC Bio, ou através de uma interface de linha de comando. · Você pode até personalizar o fluxo de trabalho do cubo desenvolvendo plug-ins de cubo especializado com a ajuda do nosso kit de desenvolvedores de software. · Performance por dólar: você terá um inigualável desempenho por dólar, em comparação com as soluções de computação de alta velocidade existentes no mercado. O que há de novo nesta versão: · Cerco fixo em seqüências de consulta muito específicas.


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