Biskit. Biblioteca Python orientada a objetos para pesquisa de bioinformática estrutural
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Biskit. Classificação e resumo

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Biskit. Descrição

Biblioteca Python orientada a objetos para pesquisa de bioinformática estrutural O Biskit é uma biblioteca de Python gratuita e aberta que fornece classes intuitivas para muitas tarefas típicas da pesquisa de bioinformática estrutural. O Biskit facilita a manipulação e análise de estruturas macromoleculares, complexos de proteína e trajetórias de dinâmica moleculares. Ao mesmo tempo, a Biskit oferece uma plataforma de software para a rápida integração de programas externos e novos algoritmos em fluxos de trabalho estruturais complexos de bioinformática. Cálculos são, portanto, delegados a programas estabelecidos como Xplor, Amber, HEX, PRASA e HMMER; Interfaces para mais software podem ser adicionados facilmente. Além disso, o Biskit simplifica a paralelização de cálculos via PVM (máquina virtual paralela). Alguns exemplos do que você pode fazer com o Biskit: · Analisar estruturas moleculares, complexos e trajetórias de dinâmica moleculares · Amostragem conformária automatizada · Modelagem automatizada de homologia · Proteína multimodel -Protein (cross-) · Cálculos de entropia quasiharmônicos · Paralelizar e automatizar seus próprios requisitos de fluxos de trabalho de bioinformática estrutural: · Pitão O que há de novo nesta versão: · Reverted setup.py de volta para usar distutils · Fornecer setup_ez.py separado para a instalação anterior EasyInstall / SetupTools · Renomear o roteiro Bispy para Bis.py para evitar problemas com instalações de setuptools. · Renomear a pasta de documentação Biskit / Docs para Biskit / Doc

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