Abacas. contigação automática algorítmica baseada em sequências de espingarda montada
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Abacas. Classificação e resumo

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visualizar alinhar Contigate Primer. Primer Alignemnt. visualize cartilha contigue

Abacas. Descrição

Contiguação automática baseada em algorítmica de sequências de espingarda montada Abacas destinada a contar rapidamente (alinhar, orientar, orientar), projetar e visualizar primers para fechar as lacunas em contigs montados em espingarda com base em uma sequência de referência.Abacas usa Mummer para encontrar as posições de alinhamento e identificar sintenes de contigs montados contra a referência. A saída é então processado para gerar uma pseudomolécula que toma contigs e lacunas sobrepostas em conta. Abacas gera um arquivo de comparação que pode ser usado para visualizar os contigs orientados e orientados no ATIONIS ACT. A sintenia é representada por barras vermelhas onde a intensidade de cor diminui com valores mais baixos de identidade percentual entre blocos comparáveis. Informações sobre contigs como a orientação, a identidade percentual, a cobertura e sobreposição com outros contigs também podem ser visualizadas carregando o arquivo de recurso de saída em ACT. Requisitos: · Mummer. · Ato de Artemis (opcional) O que há de novo nesta versão: · Esta é a última versão de abacas.

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