| Abacas. contigação automática algorítmica baseada em sequências de espingarda montada |
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Abacas. Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Sammy Assefa
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 59 KB
Abacas. Tag
Abacas. Descrição
Contiguação automática baseada em algorítmica de sequências de espingarda montada Abacas destinada a contar rapidamente (alinhar, orientar, orientar), projetar e visualizar primers para fechar as lacunas em contigs montados em espingarda com base em uma sequência de referência.Abacas usa Mummer para encontrar as posições de alinhamento e identificar sintenes de contigs montados contra a referência. A saída é então processado para gerar uma pseudomolécula que toma contigs e lacunas sobrepostas em conta. Abacas gera um arquivo de comparação que pode ser usado para visualizar os contigs orientados e orientados no ATIONIS ACT. A sintenia é representada por barras vermelhas onde a intensidade de cor diminui com valores mais baixos de identidade percentual entre blocos comparáveis. Informações sobre contigs como a orientação, a identidade percentual, a cobertura e sobreposição com outros contigs também podem ser visualizadas carregando o arquivo de recurso de saída em ACT. Requisitos: · Mummer. · Ato de Artemis (opcional) O que há de novo nesta versão: · Esta é a última versão de abacas.
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