3dna. 3DNA - Analisar e reconstruir estruturas 3D de ácido nucleico, com base em um quadro de referência padrão.
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3dna. Classificação e resumo

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3dna. Descrição

3DNA - Analise e reconstrua estruturas de ácido nucleico 3D, com base em um quadro de referência padrão. 3dna é um pacote versátil para analisar e reconstruir estruturas de ácido nucleico tridimensional, com base em uma estrutura de referência padrão. No núcleo, o software usa um esquema simples, mas matematicamente rigoroso e geometricamente sensato, para calcular um conjunto completo de par, etapa e parâmetros helicoidais, e permite a reconstrução exata de uma estrutura com base nesses recursos de parâmetros.UNIQUES do 3DNA incluem classificação automática de um passo de dinucleotídeo como A-, B- ou Ta-Like com base no posicionamento do fósforo átomos e a geração de diagramas de empilhamento de base "padronizados". Estilo de Drew Calladine recebe representações esquemáticas como modelos atômicos completos com a espinha dorsal de açúcar-fosfato e de DNA, bem graças às rotinas de reconstrução.3DNA foi criada pelo Dr. Xiang-Jun Lu no laboratório do Professor Wilma K. Olson no Departamento de Química e Biologia Química, Rutgers - Universidade Estadual de Nova Jersey. Desde que deixou Rutgers, o Dr. Lu continuou a trabalhar neste projeto como consultor independente em seu tempo livre. Este site atualizado fornece aos usuários mais informações básicas e detalhes técnicos sobre 3DNA, incluindo exemplos de trabalho. Assim, aqueles que estão realmente interessados em estruturas de ácido nucleico podem ter uma clara compreensão de "o que está acontecendo nessa caixa negra" .3dna se beneficiou muito das interações com o projeto de banco de dados de ácido nucleico (NDB) liderado pelo professor Helen Berman. Dr. Zukang Feng no PDB / NDB, Dr. AR Srinivaresan, Sr. Yurong Xin, Sr. Andrew Colasanti, Sr. Jin Tao, Ms. Fei Xu e outros membros do Olson Lab. E inúmeros usuários de todo o mundo ajudou em tornar a 3Dna uma melhor ferramenta para servir a comunidade científica.

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