Gondemical

Gondemical é um pacote de modelagem molecular com gui e ferramentas de visualização 3D.
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Gondemical Classificação e resumo

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  • GPL
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  • FREE
  • Nome do editor:
  • TH
  • Site do editor:
  • http://www.uku.fi/~thassine/ghemical/

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Gondemical Descrição

O gêmico é um pacote de modelagem molecular com gui e ferramentas de visualização 3D. O Ghemical é um pacote de software de química computacional liberado sob o GNU GPL. Isso significa que o código fonte completo do pacote está disponível e os usuários são livres para estudar e modificar o pacote. O gêmico é escrito em C ++. O projeto Get possui uma interface gráfica do usuário (que é baseado no GNOME), e suporta modelos de mecânica quântica-mecânica (semi-empírico e ab initio) e modelos de mecânica molecular (há um tripas experimental 5.2 Campo de força para a MOLECE orgânica Também uma ferramenta para modelos de proteína reduzida está incluída. A otimização da geometria, a dinâmica molecular e um grande conjunto de ferramentas de visualização estão atualmente disponíveis.Gogímico depende de código externo para fornecer os cálculos quânticos mecânicos. Semi-empírico Métodos MNDO, Mindo / 3, AM1 e PM3 vêm do pacote MOPAC7 (domínio público) e estão incluídos na distribuição de origem. O pacote MPQC (GNU GPL) é usado para fornecer métodos AB initio: os métodos baseados no Hartree-Fock A teoria é atualmente suportada com conjuntos de base que variam de STO-3G a 6-31G **. O código MPQC não está incluído na distribuição de origem. Para usar os métodos AB baseados em MPQC em Gondemical, você deve primeiro compilar e instalar primeiro a Programa MPQC para o seu sistema e, em seguida, compilar o orçamento usando algumas configurações específicas que ligam os programas juntos; Veja o arquivo de instalação para mais informações. O Gondemical também contém o pacote OpenBabel para importação e exportação de muitos formatos de arquivo diferentes (bem como outras tarefas) .installationOnce Você fez o download do lançamento mais recente, você deve extrair todos os arquivos do seu arquivo Archive usando "TAR -ZXVVF Ghemical-1.00.tgz "ou equivalentemente" Gunzip Ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf gonêmico-1.00.tar ". Depois disso, leia o "Install" -File você acabou de extrair para obter informações adicionais. O que é novo nesta versão: · O gêmico está agora indo para uma nova versão estável. · A versão atual é a versão recomendada para uso "Produção". · Não é uma liberação oficial estável por causa do recém-adicionado porto Win32, que ainda precisa de alguns toques finais antes de tudo funcionar.


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