Www :: pdb. Perl Interface para o Banco de Dados Proteína
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Www :: pdb. Classificação e resumo

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Módulo Perl. interface perl pdb. Interface Perl. Banco de dados de proteína.

Www :: pdb. Descrição

Interface Perl para o Banco de Dados Proteína O Banco de Dados de Proteína (PDB) foi estabelecido em 1971 como repositório das coordenadas atômicas de estruturas de proteína (Bernstein et al., 1997). Desde então, foi um papel, provando inestimável não apenas à comunidade de pesquisa, mas também aos estudantes e educadores (Berman et al., 2002) .www :: PDB é um módulo Perl projetado como uma interface para o banco de dados de proteína. Ele fornece funções para recuperar arquivos, opcionalmente armazená-los localmente. Além disso, ele envolve a funcionalidade do Soap Web Services do PDB.Synopsis Use WWW :: PDB QW (: ALL); # Set diretório para downloads de cache www :: pdb-> cache ('/ foo / bar'); meu $ FH = Get_Structure ('2ili'); Imprima enquanto; my @pdbids = www :: pdb-> palavra-chave_query ('anidrase carbônica'); para (@pdbids) {my $ citation = www :: pdb-> get_primary_citation_title ($ _), my @chains = www :: pdb-> get_chains ($ _); Printf ("% s% s ", $ _, $ citação, junte ('', @Chains));} Meu $ SEQ = Q (Vlspadktnvkaawgkvgahageygaalermflsfptk tyfphfdlshgsaqvkggkkvadaltavahvddmpnal); Imprimir www :: pdb-> blast ($ SEQ, 10.0, 'html,' html '); Requisitos: · Perl.

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