Viewmol. ViewMol é um construtor / editor e visualizador de moléculas para programas de modelagem molecular.
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Viewmol. Classificação e resumo

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Viewmol. Descrição

ViewMol é um construtor / editor e visualizador de moléculas para programas de modelagem molecular. ViewMol é uma extremidade gráfica de código aberto para programas de química computacional. É capaz de auxiliar graficamente na geração de estruturas moleculares para cálculos e visualizar seus resultados.VewMol foi originalmente desenvolvido pela JRG-Rdiger Hill e Andreas Bleiber no grupo Quantum Química da Universidade Humboldt com contribuições de Arne Dummer, Mariann Krossner, Andreas Bnger, e Andries de homem. O ViewMol foi nomeado um produto pendente no German / Austrian Academic Software Award 1993.Commercial Quality Software com base no ViewMol, na plataforma Materials and Processes (Maps), com funcionalidade estendida e interfaces abertas foi desenvolvido pela Scienomics e está disponível entrando em contato com informações @ scienomics.com. O Maps é compatível com o ViewMol, por exemplo, com relação aos filtros de entrada e saída. Aqui estão algumas características principais de "ViewMol": · Construção e edição de moléculas · Visualização da geometria de uma molécula como molécula de arame, palito, bolas e modelos de CPK · Rastreamento de uma otimização de geometria ou uma trajetória de MD Animação de vibrações normais ou para mostrá-las como setas · Desenho de IR, Raman e espectros de espalhamento de nêutrons inelásticos · Desenho de um nível de energia MO ou densidade de estados Diagrama · Desenho de funções de base, orbitais moleculares e densidades de eletrônicos · Desenho de propriedades Definido em uma grade · Exibição de forças que atuam em cada átomo em uma determinada configuração · Cálculo de quantidades termodinâmicas para moléculas e reações entre elas · Desenhos gerados por ViewMol podem ser salvos como arquivos TIFF, PNG, HPGL ou PostScript · Animações de modos normais pode ser convertido em um arquivo de vídeo (MPEG), e. g. Para a inclusão em documentos da World Web (requer programas adicionais disponíveis na Internet) · Interface para o programa Ray Rastreing POVRAY (geração de arquivos de entrada e uso de povray de dentro do ViewMol) · Entrada e saída em uma variedade de formatos, novos formatos podem ser Adicionado facilmente pelo usuário · Intérprete Python incorporado para a AutomationViewMol é atualmente capaz de trabalhar com: · Saídas Gaussian · Descubra Arquivos · Saídas DMOL3 · Saídas de Gamess · Saídas Gauss · Saídas do Mopac · Arquivos PQS · Arquivos de Turbomole · Vamp SAÍDAS · Qualquer arquivo de estrutura molecular suportado por Open BabelViewMOL pode atualmente escrever: · Arquivos de Turbomole · Arquivos de Carro e Arc Accelrys · Arquivos de Entrada Gaussianos · Arquivos MDL · Qualquer arquivo de estrutura molecular suportado por Open BabelWhat's New nesta versão: · Suporte para Gaussian 03 resultados · Suporte para saídas de Vamp · Um recurso "atraso" para controlar a velocidade de animação · Interface do usuário em turco (incompleto) · Removido dependência do libcxa.so introduzido pela Intel C Compiler · Algumas correções de bugs

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