Pybpn. Identifique conexões significativas entre processos biológicos usando redes de interação genética
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Pybpn. Classificação e resumo

Pybpn. Tag

Conexões biológico

Pybpn. Descrição

O Pybpn é um módulo Python que fornece programas para detectar conexões entre processos biológicos (chamados de "links") com base em dados de interação, expressão e anotação do gene. Uma coleção de links significativos e os processos participantes formam uma rede de processos biológicos, ou BPN.pyBPN fornece três programas relacionados para encontrar BPNs, cada um com diferentes objetivos: BPLN determina se os processos são geralmente conectados; uma implementação do algoritmo descrito por Dotan-Cohen et al. .CBPN determina se, sob uma determinada comparação de condições, as conexões entre os processos são perturbadas; uma implementação do algoritmo descrito por Lasher et al. .mcmcbpn semelhante ao CBPN, mas tenta descobrir o menor conjunto de conexões que descrevem tanto da perturbação de genes interagindo quanto possível.

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