Obitools. scripts e biblioteca para análise de seqüência biológica
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Obitools. Classificação e resumo

Obitools. Tag

Biblioteca Python. analisador seqüência biológico análise de sequência biológica

Obitools. Descrição

Scripts e biblioteca para análise de sequência biológica Obitools é um conjunto de scripts Python criados para simplificar a manipulação de arquivos de sequência em nossos laboratórios. Eles eram principalmente design para nos ajudar durante a análise das saídas do seqüenciador da próxima geração (454 ou solexa). Esses scripts dependem de uma biblioteca Python do mesmo nome "Obitools''A biblioteca e os scripts evoluíram com nossas necessidades. Eles fornecem principalmente instalações para manipular arquivos de seqüência no formato FASTA. Outros formatos são suportados como Genbank ou EMBL.O '' 'Obtools' 'Scripts Os scripts OBITOOLS pretendem ajudá-lo a manipular vários dados e arquivos de sequência de uma maneira conveniente usando a interface da linha de comando Unix. Eles seguem a interface padrão do UNIX para o programa de linha de comando, permitindo encadear um conjunto de scripts usando o mecanismo do tubo.Todos estes scripts têm uma opção -h imprimindo uma pequena ajuda on-line para descrever as diferentes opções aceitas pelo script. Se uma opção é Compartilhado por vários scripts, esta opção é nomeada pela mesma letra em todos esses scripts. Isso é feito para facilitar o uso de scripts de obitools. Da mesma forma, usualy, o nome de um script começa com um prefixo indicando o formato do arquivo de entrada. O Python LibraryObitools '' '' '' '' '' '' 'Python é um conjunto de scripts, mas também uma biblioteca Python. Você pode usar esta biblioteca livremente para criar seus próprios scripts. Requisitos: · Pitão

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