NMR-RELAX

NMR-RELAX é projetado para o estudo da dinâmica de proteínas ou outras macromoléculas.
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NMR-RELAX Classificação e resumo

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  • Licença:
  • GPL
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  • FREE
  • Nome do editor:
  • Edward d'Auvergne
  • Site do editor:
  • https://gna.org/projects/minfx/

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NMR-RELAX Descrição

NMR-RELAX é projetado para o estudo da dinâmica de proteínas ou outras macromoléculas. O NMR-RELAX é projetado para o estudo da dinâmica de proteínas ou outras macromoléculas, embora a análise dos dados de relaxamento da NMR. É um projeto acionado pela comunidade criado por espectroscopistas de NMR para os espectroscopistas de NMR.it suporta encaixe de curva exponencial para o cálculo das taxas de relaxamento R1 e R2, cálculo do NOE, redução do mapeamento de densidade espectral e da análise sem modelo Lipari e Szabo. Aqui estão algumas características principais de "NMR-RELAX": · Teorias de NMR suportadas As seguintes técnicas de análise de dados de relaxamento são atualmente suportadas por Relax: · Análise sem modelo (Lipari e Szabo, 1982a; Lipari e Szabo, 1982b; Clore et al., 1990) · Mapeamento de densidade espectral reduzido (Farrow et al., 1995, Lefevre et al., 1996) · Montagem de curva exponencial (para encontrar as taxas de relaxamento R1 e R2) · Cálculo do Noe State-State-State · Ferramentas de análise de dados As ferramentas a seguir são implementadas como componentes modulares a serem usados por qualquer técnica de análise de dados: · Numerosos algoritmos de otimização de alta precisão · Seleção de modelos (d'auvergne e Gooley, 2003) · Os critérios de informação de akaike (AIC) · Pequeno tamanho de amostra corrigido AIC (AICC) · Bayesian ou Critérios de Informação de Schwarz (BIC) · Seleção de modelo de bootstrap · Validação cruzada de item único (CV) · Testes de hipóteses ANOVA model seleção (somente a técnica específica sem modelo de Mandel et al., 1995 é suportada) · Simulações de Monte Carlo (Análise de Erros para todas as técnicas de análise de dados) · Eliminação de modelos - a remoção de modelos com falha antes da seleção de modelos (D'Auvergne e Gooley, 2006) Requisitos: · Pitão O que há de novo nesta versão: · Esta é uma versão muito menor de bugfix que resolve problemas com a função Value.Write () e com análise de erros ao executar a conexão de relaxamento.


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