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Mq2. Classificação e resumo
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- Licença:
- GPL v3
- Preço:
- FREE
- Nome do editor:
- Pierre-Yves Chibon
- Site do editor:
- http://github.com/pypingou/
Mq2. Tag
Mq2. Descrição
MQ2 Simple Python Module para processar a saída do MapQtl Analysis.Assuming um QTL por grupo de ligação e usando o limite de LOD definido pelo usuário. Esse aplicativo extrai todos os QTLs detectados pelo MAPQTL, usando o arquivo de mapa do joinMap, ele encontra o marcador mais próximo e, finalmente, coloca o número de QTLs encontrados para cada marcador no mapa. Esta abordagem permite que você encontre o potencial QTL hotspot no seu conjunto de dados. Isto é particularmente útil para uma grande análise QTL em um grande número de traços.Instalar o projeto: Existem duas maneiras de instalar este projeto: a partir das fontes - Clone O SourceGit Clone https://github.com/pbr/mq2.git- Digite a pasta e execute o setup.py scriptcd mq2sudo python setup.py installfrom pypi- download e instale o projeto de PyPiEasy_install mq2run o projeto: para executar o projeto, basta executar o script MQ2 fornecido.See mq2 --help ou mq2 -h Para o argumento diferente disponível. Este projeto contém testes de unidade permitindo que você verifique se o código se comporta como deveria. Para executá-los, duas maneiras, ou: Nosetestsfrom a pasta MQ2 ou: Python test.pypage na página inicial do teste do teste.
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