Vics-II.
VICS-II Project é a próxima geração de vics, que foi originalmente desenvolvida por Fujio Izumi e Ruben A. ...
 | MalvaConstrói vários alinhamentos múltiplos de seqüências de genoma rearranjado |
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- Aaron Darling
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- http://www.cs.wisc.edu/~darling/libgenome/
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Malva Descrição
Constrói vários alinhamentos múltiplos de seqüências de genômicas rearranjadas O MAUVE Project é um sistema para construir eficientemente os alinhamentos de genoma múltiplo na presença de eventos evolucionários em larga escala, como rearranjo e inversão. O alinhamento genoma de mitiplagem fornece uma base para a pesquisa em genômica comparativa e o estudo da dinâmica evolutiva em uma nova escala. Alinhando genomas inteiros é um problema fundamentalmente diferente do que alinhar seqüências curtas.Mauve foi desenvolvido com a ideia de que um alinhador de genoma múltiplo deve exigir apenas recursos computacionais modestos. Emprega técnicas algorítmicas que estão bem na quantidade de seqüência sendo alinhadas. Por exemplo, um par de genomas de Y. Pestis pode ser alinhado em menos de um minuto, enquanto um grupo de 9 genomas enterobacterianos divergentes pode ser alinhado em poucas horas.
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