MASSPEC :: CUSTITILIDADES. MASSSPEC :: STRATIDADES é uma extensão Perl contendo serviços C para uso em espectrometria de massa.
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MASSPEC :: CUSTITILIDADES. Classificação e resumo

MASSPEC :: CUSTITILIDADES. Tag

extensão perl espectrometria de massa Extensão perl. C utilities.

MASSPEC :: CUSTITILIDADES. Descrição

Massspec :: Cuties é uma extensão Perl contendo utilidades C para uso em espectrometria de massa. MASSPEC :: STRATIDADES é uma extensão Perl contendo utilitários C para uso em espectrometria de massa.synopsismassspec :: cuties é um módulo XS, então há uma chance de que você ou seu usuário-alvo possa não conseguir instalar limpo no sistema de destino; Por conseguinte, é recomendável tornar a sua presença opcional e oferecer equivalentes de perl de execução mais lenta em que é prático.Also nota que este módulo utiliza um alfabeto amino de 19 letras, em vez do tradicional alfabeto de 20 letras, já que os isobars leucina (L) e isoleucina (L) I) são representados por "X". Além disso, algumas porções deste módulo assumem que seus peptídeos de entrada estão internamente em ordem alfabética. Meu $ HAVUPLUPITÁRIO; Se (eval 'exigir masspec :: cuties') {Importar Massspec :: Cuties; $ HAVIFULITÁRIO = 1; } else {$ Hav-poder = 0; } Se ($ HAVULITÁRIO) {MEU $ candidato = Massspec :: Cuties :: EncodeasTring ("Accgt"); my @shortpeptides = ("ato", "ccgm", "acccty", "cct"); minha (lista @, @ resposta); foreach $ _ (@shortpeptides) {push @list, massspec :: cuties :: EncodeasTring ($ _); } If (Massspec :: Circuties :: TestmanyBitsTrings ($ candidato, @ shortpeptides, lista @, @ Resposta)) {# deve imprimir "ACT" e "CCT" só imprimir "correspondente:". Junte-se (',', @ Resposta). "N"; }} Consulte a documentação da API para outra mistura eclética de sub-rotina disponível de utilitários C usados originalmente em um projeto de sequenciamento de espectrometria de massa Denovo no NIH. Inclui um decodificador de Huffman Rápido adequado (com pequenas modificações) para uso com o algoritmo do módulo CPAN :: Huffman, bem como uma calculadora de massa péptida rápida e métodos para codificação de peptídeos como produtos de números primos ou como bitmaps.an mistura eclética de c Utilitários originalmente usados em um projeto de sequenciamento de espectrometria de massa denovo no NIH. Inclui um decodificador de Huffman rápido adequado (com pequenas modificações) para uso com o algoritmo do módulo CPAN :: Huffman, bem como uma calculadora de massa péptida rápida e métodos para codificar peptídeos como produtos de números primos ou como bitmaps. Requisitos: · Perl.

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