Insilicospectro :: Insilico :: MsmsOutput Insilicospectro :: insilico :: msmsOutput é um objeto implementando métodos comuns de exibição / saída para massas.
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Insilicospectro :: Insilico :: MsmsOutput Classificação e resumo

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Módulo Perl. exibição comum Métodos de saída exibição comum

Insilicospectro :: Insilico :: MsmsOutput Descrição

Insilicospectro :: Insilico :: MsmsOutput é um objeto implementando métodos comuns de exibição / saída para massas. Insilicospectro :: MSMSOutput é um objeto implementando métodos comuns de exibição / saída para massas.attributeSpectRuma referência a um hash como calculado por masscalculator :: getfragmentmasses ou um objeto de classe msmsheospectrum.expspectruma referência a um espectro experimental, como exigido por MassCalculator :: matchclosest ou um objeto de classe expspectrum. Quando este parâmetro é especificado, o construtor assumirá que o espectro do hash contém dados sobre a correspondência com este espectro experimental.MassindexThe o índice de massa nos vetores de pico experimental, padrão 0. Se o parâmetro expspectrum for um objeto Expspectrum, este índice é lido do objeto diretamente .InstituinteIndexThe índice de intensidade nos vetores de pico experimental, padrão 1. Se o parâmetro expspectrum for um objeto Expspectro, este índice é lido do objeto diretamente. Tolerância de erro de massa de massa; Este parâmetro é opcional. Quando não especificado, as massas correspondentes encontradas pelo algoritmo de match são prescervados. Quando especificado, a nova tolerância é aplicada. Este parâmetro é útil principalmente para correspondência obtida via matchspectrumclosest que não aplica qualquer tolerância a massa.Mintolabsolute massa de erro, valor padrão 0.2 da. Esse parâmetro é usado apenas no parâmetro Case Tol é especificado, veja o parâmetro acima.NTEselThis Controla como as intensidades do pico são normalizadas, consulte a função NormalizeInsities.Parameter InStel é usado para o Expspectrum foi definido .Precthe número de dígitos após os pontos decimais para as massas. A precisão padrão é de 3 dígitos.ModiflVlControls Como as modificações são destacadas no splitpept vector definido abaixo, consulte também a função ANOTATEPEPT.CMPTE parâmetro é uma referência a uma função de comparação usada para classificar nomes de fragmentos. Se o CMP não estiver definido, a função CMPFragTypes é usada. Requisitos: · Perl.

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