Grammy. Abundância relativa do genoma usando modelos de mistura
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Abundância relativa do genoma usando modelos de mistura O Grammy é um módulo Python que fornece ferramentas para estimativa de abundância metagenômica com base nas partições de probabilidade de leitura (alinhamento ou composição baseada) .grammy é um quadro computacional desenvolvido para a abundância relativa do genoma usando a estimativa baseada em teoria do modelo de mistura (Grammy). Estimativa precisa da composição comunitária microbiana com base em dados de sequenciamento metagenômico é fundamental para a análise de metagenómicos. Os métodos de estimativa do Trevalent são baseados principalmente em resumir diretamente os resultados de alinhamento ou suas variantes; muitas vezes resultam em estimativas tendenciosas e / ou instáveis. Desenvolvemos a abundância relativa do genoma usando a abordagem da teoria do modelo de mistura (Grammy) estimativa A abundância relativa do genoma baseada na espingarda Leite.Grammy foi demonstrado para dar estimativas que são precisas e robustas em todos os conjuntos de dados de referência ler simulados e reais. Requisitos: · Pitão

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