Gabedit.

GUI para Gaussian e Molpro.
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Gabedit. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • BSD License
  • Preço:
  • FREE
  • Nome do editor:
  • Allouche abdul-Rahman
  • Site do editor:
  • http://lasim.univ-lyon1.fr/allouche/gabedit

Gabedit. Tag


Gabedit. Descrição

GUI para Gaussian e Molpro. Gabedit é uma interface gráfica do usuário para Gaussian, Molcas, Molpro e pacotes de química computacional MPQC. Gabedit inclui instalações gráficas para gerar palavras-chave e opções, especificações moléculas e utras seções de entrada mesmo para os mais tipos de cálculo avançados Gabedit inclui um avançado Molecule Builder. Você pode usá-lo para esboçar rapidamente em moléculas e examiná-los em três dimensões. É possível construir moléculas por átomo, anel, grupo amino ácido e nucleósido. Você também pode ler a geometria de um arquivo. A maioria dos principais formatos de arquivo molecular são suportados. Gabedit inclui uma janela de configuração Cálculo Gaussian, Molcas, Molpro e MPQC que lhe permite configurar Gaussian, Molcas, Molpro e empregos MPQC de forma simples e maneira direta. Gabedit inclui um editor de texto para editar arquivos de entrada Molcas, Molpro, Gauss e MPQC. Gabedit graficamente pode exibir uma variedade de Gauss, Molcas, Molpro, MPQC e (parcialmente) os resultados dos cálculos AAD, incluindo a seguinte: · orbitais moleculares. · Superfícies da densidade de electrões, potencial electrostico, densidade de RMN de blindagem, e outras propriedades. · As superfícies podem ser exibidos em modos de malha de arame sólido, translúcido e. · As superfícies podem ser colorido por uma propriedade separada. · Contornos (codificado por cores). · Planos (codificado por cores). · · Dipolo eixos XYZ e os eixos principais da molécula. · Animação dos modos normais correspondentes a frequências vibratórias. · Animação da rotação da geometria, a superfície, dipolo, xyz e os eixos principais da molécula. · Animação de contornos. · Animação de aviões codificados por cor. Gabedit pode exibir IR e Raman calculado espectros. Gabedit pode gerar um ficheiro para povray geometria (átomos + ligações, incluindo ligação de hidrogénio), as superfícies (incluindo superfícies codificado por cor), contornos, aviões codificados por cor. Gabedit pode salvar imagem em PPM, BMP, (JPEG) e formato PS. Gabedit pode gerar automaticamente uma série de imagens de animação (vibração, a convergência geometria, rotação, contornos, aviões codificados por cor) Requisitos: · GTK +. O que há de novo nesta versão: · Pequenos bugs foram corrigidos · Todas as modificações geométricas pode ser desfeita e refeita usando o desfazer e refazer (U / L ou Ctrl z / y Ctrl) · O usuário tem controle completo sobre os títulos exibidos em um desenho. · O desenho da molécula átomo por átomo foram simplificados. · O desenho do fragmento de molécula por fragmento foram simplificados. · Gabedit ler conectividades de Gabedit, hin, PDB, mol2 e arquivos mol. · O utilizador pode definir o valor da distância, ângulo de ligação e ângulo diedro. · Dinâmica A Molecular pesquisa conformacional é implementado usando um potencial MM (Âmbar 99). · Dinâmica A Molecular pesquisa conformacional é implementado usando um método semi-empírico (a partir de Abrir Mopac ou PCGamess). · A migração de funções de desenho GDK para Cairo: Rendição Cross-dispositivo para gráficos vetoriais. · Cairo é agora utilizado para o XYplot Gabedit widget (utilizado por Gabedit para espectros de estiramento). · Cairo é usado agora para a janela de desenho da geometria. · Geometry podem ser exportados em EPS, PS, PDF ou arquivo SVG. · As curvas de janela XYplot podem ser exportados em EPS, PS, PDF ou arquivo SVG. · Nova ferramenta para a distância de computação entre 2 pontos na janela XYPlot. "Tecla Shift Control +" pode ser usado para fazer um zoom na janela XYPlot. · A nova versão do PCGamess (vaga-lume) é agora suportado


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