GO :: Model :: Term

Go :: Model :: Termo é um termo ou conceito em uma ontologia.
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Vá :: Modelo :: Termo é um termo ou conceito em uma ontologia. GO :: Model :: Termo é um termo ou conceito em uma ontologia.synopsis # de um uso de arquivo, GO :: Parser; Meu $ parser = New Go :: Parser ({Handler => 'Obj'}); # Criar Objeto de Parser $ Parser-> Analisar ("Gene_ontology.obo"); # PARSE FILE -> Objetos Meu $ Gráfico = $ Parser-> Handler-> Gráfico; # obter l objeto meu $ termo = $ graph-> get_term ("go: 0001303"); # Buscar um termo por ID Printf "Term% S% SN", $ Term-> Nome, $ Term-> Acc; # De um banco de dados Go (requer Go-DB-Perl) Meu APPH = GO :: AppHone-> Connect (-DBName => $ DBName); meu $ termo = $ APPH-> get_term ({acc => 00003677}); Printf "Termo:% s (% s) NDefinition:% SNSYNONYMS:% sn", $ Term Term-> Nome, $ Term-> Public_Acc, $ Term-> Definição, Junte-se (", @ {$ TERMER-> SINONYMYLIST }); Representa um termo de ontologia; A mesma classe é usada para processo, compartimento e funcoundcorrently, um termo não está ciente de suas relações; Para descobrir como um termo está relacionado a outros termos, use o objeto AC :: Model :: Graph Object, que lhe dará o GO :: Model :: Objetos de relacionamento; Por exemplo $ REL = $ graphical-> get_parent_relationships ($ termo-> acc); Requisitos: · Perl.


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