Flipdcd. flipdcd inverte o endianismo de arquivos de trajetória de dinâmica molecular DCD binária.
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Flipdcd. Classificação e resumo

Flipdcd. Tag

dinâmica trajetória trajetória dinâmica Flipdcd.

Flipdcd. Descrição

FlipDCD inverte a endianism de DCD dinâmica molecular binários arquivos de trajetória. FlipDCD é um pequeno utilitário para reverter o endianism de arquivos de trajetória binários DCD de CHARMM e NAMD. Isso pode ser útil ao executar simulações em uma arquitetura e visualizar ou analisar os resultados no another.FixDCD é um pequeno utilitário para modificar o cabeçalho de um arquivo X-PLOR DCD para torná-lo legível por programas que esperam arquivos CHARMM DCD, em detrimento da valor do tamanho de um instante temporal no header.FlipDCD fornece um mecanismo para converter o endianism (ordenação byte) de CHARMM, X-PLOR, e arquivos de trajectória NAMD DCD de modo que eles podem ser carregados por programas de visualização e de análise em plataformas com a ordenação byte oposto da plataforma sobre a qual eles foram originalmente generated.This permite usar um PC Windows para ler trajetórias DCD gerados em um Sun ou um SGI e permite a Sun ou um SGI para ler arquivos de trajetória produzidos em um cluster de PC rodando Linux.FlipDCD faz a conversão endianness pela memória mapear o arquivo DCD com mmap (), e convertendo o endianism no local. Isto fornece um método relativamente alto desempenho para executar endianness conversion.FlipDCD pode ser usado para relatar o status endian de arquivos DCD ou para forçar uma ordenação particular, sem levar em conta a origem do uso DCD files.FlipDCD: flipdcd arquivo. . . onde "arquivo" pode ser uma lista de comportamento padrão files.The é inverter a ordem de bytes. Outras opções são: -s relatar o status de ordem de byte de cada arquivo sem alterá-lo -B fazer / manter cada arquivo de big-endian -L make / manter cada arquivo little-endian As opções são mutuamente exclusivas; a última leitura é used.FixDCD muda o cabeçalho em um estilo X-PLOR DCD arquivos para que eles possam ser lidos por ferramentas que esperar CHARMM formatado arquivos de trajetória. Tal como acontece com FlipDCD, FixDCD executa a conversão no local. Esta conversão não é reversível assim que você pode querer fazer uma cópia de backup de seu arquivo (s).

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