Brickit Brickit ajuda os biólogos sintéticos a planejar, rastrear e organizar suas amostras locais de BioBrick.
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Brickit ajuda os biólogos sintéticos a planejar, rastrear e organizar suas amostras locais de BioBrick. O Brickit tem como objetivo criar um registro portátil baseado na Web que ajuda os biólogos sintéticos a planejar, rastrear e organizar suas amostras locais de BioBrick. O servidor da Web apoiado pelo banco de dados pode ser baixado como máquina virtual para configurar rapidamente um registro local que coordena o trabalho dentro de um laboratório, instituto ou comunidade. Embora os dados permaneçam locais, o próprio servidor da Web é um projeto de código aberto e novas funções ou melhorias podem ser facilmente trocadas entre os diferentes registros locais. Brickit, portanto, também oferece uma plataforma para o desenvolvimento compartilhado de ferramentas e infraestrutura que fomenta a colaboração dentro da comunidade de biologia sintética. Brickit e tudo o que depende são de código aberto e grátis. O brickit é licenciado sob o GPL.background Biólogos sintéticos visam projetar e implementar dispositivos complexos de um conjunto de blocos de construção biológicos padronizados que são denominados biobricks. Biobricks são fragmentos de DNA que são abertamente e livremente compartilhados em toda a comunidade de biólogos sintéticos - um repositório público no MIT (http://parts.edu) coleta a descrição de cada biobrick submetido e também mantém amostras do DNA. O que faltam são meios para apoiar o trabalho nos laboratórios individuais antes da apresentação de biobricks acabados e testados. Projetos típicos dependem de dezenas ou mais biobricks básicos e produzem facilmente centenas de construções intermediárias que estão flutuando em inúmeros tubos de teste. O arquitectureBrickit implementa um servidor Web Django apoiado pelo banco de dados. Django é um popular estrutura web modular e orientada a objetos escrita na linguagem de programação Python. Tanto o modelo de dados quanto a interface da Web são encapsulados em um pacote Python bastante simples - o banco de dados é criado na mosca e não precisa ser manipulado diretamente. Isso tem a vantagem de que (1) é fácil de configurar (tão fácil que mesmo eu gerenciei :-) Sem conhecimento prévio de bancos de dados ou SQL), (2) Todas as partes do projeto são formuladas em uma única linguagem elegante que permite Para fácil modificação, (3) dados reais, modelo de dados e representação de dados são claramente separados, (4) melhorias para a interface da Web e o modelo de dados podem ser coordenadas com ferramentas comprovadas para desenvolvimento de software compartilhado (Subversion, SourceForge). Instalação completa do servidor da Web, completa com sistema operacional, banco de dados PostgreSQL e Apache, é fornecido como máquina virtual para implantação rápida.Statusnote, o projeto mal iniciado (pré-alfa-estado?). A arquitetura básica está em vigor e parece funcionar (veja screenshots), mas as melhorias são necessárias em todos os lugares: o modelo de dados precisa ser discutido, a interface do usuário precisa ser melhor personalizada, o servidor virtual pode não estar perfeitamente configurado, a troca de Biobricks Entre registros de brickit ou com o registro de peças do MIT não é implementado, ... como contribuir com a ajuda é muito apreciada, de fato, se quisermos ir além do estágio de protótipo atual. Mesmo se você não conhece o Python, há tarefas para muitos conhecimentos: web design, javascript, bancos de dados, administração do sistema ... ou você pode ajudar testando, documentando, melhorando este wiki (ou criando um melhor), discutindo o modelo de dados, ...

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