Bioperl. Extensões Perl para BioInformatics.
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Bioperl. Classificação e resumo

Bioperl. Tag

perl Extensões bioperl. extensões Perl

Bioperl. Descrição

Uma extensão perl para bioinformática. O projeto BioPerl é uma coleção de módulos Perl que facilitam o desenvolvimento de scripts Perl para aplicações de bioinformática. Como tal, não inclui programas prontos para uso no sentido de que muitos pacotes comerciais e interfaces gratuitas baseadas na Web do (por exemplo, Entrez, SRS). O outro lado, o BioPerl fornece módulos de perl reutilizáveis que facilitam os scripts de escrita Perl para sequência Manipulação, acessando os bancos de dados usando uma gama de formatos de dados e execução e análise dos resultados de vários programas de biologia molecular, incluindo explosão, Clustalw, TCOFFEE, Genscan, Estscan e Hmmer. Consequentemente, o BioPerl permite a desenvolver scripts que podem analisar grandes quantidades de dados de sequência de maneiras que são tipicamente difíceis ou impossíveis com sistemas baseados na web.Endo para aproveitar o Bioperl, o usuário precisa de uma compreensão básica da linguagem de programação Perl, incluindo uma compreensão de Como usar referências perl, módulos, objetos e métodos. Se esses conceitos não estiverem familiarizados, o usuário é encaminhado a qualquer um dos vários livros introdutórios ou intermediários sobre Perl., gostei do idioma principal do Perl do S. Holzmer, o Coriolis Technology Press, por exemplo. Este tutorial não se destina a ensinar os fundamentos de perl àqueles com pouca ou nenhuma experiência na linguagem Perl. Por outro lado, o conhecimento avançado do Perl - como como escrever um módulo Perl orientado a objetos - não é necessário para usar com êxito o Bioperl.bioperl é o software de código aberto que ainda está sob desenvolvimento ativo. As vantagens do software de código aberto são bem conhecidas. Eles incluem a capacidade de examinar e modificar livremente o código de origem e a isenção de taxas de licenciamento de software. No entanto, uma vez que o software de código aberto é normalmente desenvolvido por um grande número de programadores voluntários, o código resultante geralmente não é tão claramente organizado e sua interface de usuário não padronizado como em um produto comercial maduro. Além disso, em qualquer projeto sob desenvolvimento ativo, a documentação pode não acompanhar o desenvolvimento de novos recursos. Consequentemente, a curva de aprendizagem para ativamente desenvolvida, o software de fonte de código aberto é às vezes íngreme. Requisitos: · Perl. O que há de novo nesta versão: · Esta é a primeira liberação do núcleo na série 1.6, e a primeira liberação estável após 5 anos de liberação de desenvolvimento.

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