Bio :: Tools :: adivinheqFormat Um módulo para determinar o formato de sequência do conteúdo de um arquivo, uma string ou através de um filehandle
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Bio :: Tools :: adivinheqFormat Classificação e resumo

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Módulo Perl. perl formato seqüência Formato de seqüência FileHandle String.

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Um módulo para determinar o formato de sequência do conteúdo de um arquivo, uma string ou através de um filehandle Bio :: Tools :: adivinheqefformat é um módulo Perl para determinar o formato de sequência do conteúdo de um arquivo, uma string ou através de um filehandle.synopsis # para adivinhar o formato de um arquivo simples, dado um nome de arquivo: Bio :: Ferramentas :: adivinheqFormat-> Novo (-File => $ filename); Meu formato $ = $ adivinhador-> Adivinha; # Para adivinhar o formato de um arquivo já aberto: Meu $ adivinhador = Bio :: Tools :: adivinheqFormat-> Novo (-FH => $ filehandle); Meu formato $ = $ adivinhador-> Adivinha; # Se o FileHandle for procurado (Stdin não é), será retornado à sua posição original. # Para adivinhar o formato de uma ou várias linhas de texto (com # newlines incorporados): Meu $ adivinhador = Bio :: Tools :: adivinheqFormat-> Novo (Text => $ linesoftoxt); Meu formato $ = $ adivinhador-> Adivinha; # Para criar um objeto Bio :: adivinhe o objeto e definir o nome de arquivo #, filehandle ou linha para analisar depois: Meu $ adivinhador = Bio :: Tools :: adivinhadoqFormat-> Novo (); $ adesivo-> arquivo ($ filename); $ adesão-> FH ($ filehandle); $ adesão-> texto ($ linesofext); # Para adivinhar de uma só vez, dado, e. Um nome de arquivo: Minha $ Format = Bio :: Ferramentas :: AdivinheqFormat-> Novo (-File => $ Filename) -> Adivinha; Bio :: Ferramentas :: adivinhamentoSeqFormat tenta adivinhar o formato ("suíço", "pir", "FASTA" etc.) da sequência ou MSA em um arquivo, em um escalar, ou através de um arquivo filehandle. O objeto Adivinhe () de uma Bio :: Ferramentas :: Adivinhamento do ObjectSeqFormat examinará os dados, a linha por linha, até encontra uma linha para a qual apenas um formato pode ser atribuído. Se nenhuma adivinhação conclusiva puder ser feita, o UNDEF é retornado. Se o objeto Bio :: Ferramentas :: AdivinheSeqFormat recebe um arquivo handandle que é procurado, ele será restaurado à sua posição original no retorno do método Adivinhe (). Requisitos: · Perl.

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