Bio :: Tools :: Run :: PisApplication :: Align2Model

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Bio :: Tools :: Run :: PisApplication :: Align2Model Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Perl Artistic License
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  • FREE
  • Nome do editor:
  • Catherine Letondal
  • Site do editor:
  • http://search.cpan.org/~birney/bioperl-run-1.4/Bio/Tools/Run/PiseApplication/fasta.pm

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Bio :: Ferramentas :: Run :: PisApplication :: Align2Model é uma classe bioperl para align2model - criar um alinhamento múltiplo de seqüências ... Bio :: Ferramentas :: Executar :: PisApplication :: Align2Model é uma classe bioperl para align2model - Crie um alinhamento múltiplo de seqüências a um modelo existente.Parameters: Align2Model (string) Executar (sequência) Seqüências de execução DB (seqüência) para alinhar (-dB) Modelo Modelo_file (infile) (-i) tubo: Sam_Model ID (string) Seleção (s) de seqüência (separada por vírgulas) NSCoreseq (inteiro) Número máximo de sequências a serem lidas (-nscoreseq) adpstyle (excl) estilo de programação dinâmica (-Adpstyle sw (excl) sequence scoring (-sw) auto_fim (switch) Adicionar FIMS automaticamente (-Auto_fim) jump_in_prob (float) custo probabilidade de saltar no centro do modelo (-jump_in_prob) jump_out_prob (Flutuador) custo de probabilidade de saltar fora do centro do modelo (-Jump_out_prob) A2Mdots (switch) Imprimir pontos para preencher a necessidade de espaço para outras inserções de seqüências (-A2Mdots) Dump_Parameters (- -Dump_parameters): · Perl.


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