Bio :: Seqio :: FASTA Bio :: Seqio :: FASTA é um módulo Perl com fluxo de entrada / saída de seqüência FASTA.
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Bio :: Seqio :: FASTA Classificação e resumo

Bio :: Seqio :: FASTA Tag

Módulo Perl. seqüência seqüência FASTA FASTA. bioperl. fluxo de saída.

Bio :: Seqio :: FASTA Descrição

Bio :: Seqio :: FASTA é um módulo Perl com fluxo de entrada / saída de seqüência FASTA. Bio :: Seqio :: FASTA é um módulo Perl com FASTA Sequence Entrada / saída de saída.AppendixThe o resto da documentação Details cada um dos métodos de objeto. Os métodos internos são geralmente precedidos com um título _next_seq: Next_seq Uso: $ SEQ = $ stream-> next_seq () Função: Retorna a próxima sequência nos retornos do fluxo: Bio :: SEQ Object Args: Nonewrite_SEQ Título: Write_Seq Uso: $ stream- > Write_SEQ (@SEQ) Função: grava o objeto $ SEQ para o stream retornos: 1 para o sucesso e 0 para erro args: Array de 1 a n bio :: primordialsqi objetoswidth título: largura Uso: $ obj-> largura ($ newval ) Função: Obter / definir a largura da linha para retornos de saída FASTA: Valor de largura Args: NewValue (opcional) Prefred_id_Type Title: prefred_id_type Uso: $ obj-> preferível_id_type ('adesion') Função: Obtenha / definir o tipo preferido de identificador para Use na posição "> ID" para saída FASTA. Retorna: String, um dos valores definidos no @bio :: Seqio :: FASTA :: seq_id_types. Padrão = $ Bio :: Seqio :: FASTA :: Default_SEQ_ID_TYPE ('display'). Args: string ao configurar. Este deve ser um dos valores definidos no @bio :: Seqio :: FASTA :: seq_id_types. Valores permitidos: adesão, adesão.Version, exibição, lances primários: Exceção fatal Se o tipo de ID fornecido não estiver em @SEQ_ID_TYPES. Requisitos: · Perl.

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