Bio :: SEQ :: seqwithqualidade bio :: seq :: seqwithqualidade é um objeto bioperl empacotando uma sequência com sua qualidade.
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Bio :: SEQ :: seqwithqualidade Classificação e resumo

Bio :: SEQ :: seqwithqualidade Tag

Módulo Perl. objeto seqüência bioperl. Objeto Bioperl embalagem de sequência

Bio :: SEQ :: seqwithqualidade Descrição

Bio :: SEQ :: SEQWithQuality é um objeto BioPerl empacotando uma sequência com sua qualidade. Bio :: Seq :: SeqwithQuity é uma embalagem de objeto bioperl Uma sequência com sua qualidade.Synopsis usa Bio :: Prementyseq; Use Bio :: Seq :: Primário; # Make from Memory My $ Qual = Bio :: Seq :: SeqwithQuity-> Novo (-Qual => '1020305050502010 ', -SQ =>' atcgatcg ', -id =>' human_id ', -accession_number => 'al000012',); # FAZ A partir de objetos # primeiro, faça um objeto principalSQ Meu $ SEQOBJ = BIO :: primordialSQ-> NOVO (-seq => 'atcgatcg', -id => 'genefragment-12', -acession_number => 'x78121', - Alfabeto => 'DNA'); # Agora faça um objeto Primário Qual Meu $ Qualobj = Bio :: Seq :: Prinatequal-> NOVO (-QUAL => '1020304050502010 ', -ID =>' GeneFragment-12 ', -Acession_number => 'X78121', -Alphabet => 'DNA'); # Agora faça o objeto SEQWithQuity My $ SWQOBJ = BIO :: Seq :: SeqwithQuity-> Novo (-seq => $ SEQOBJ, -QUAL => $ QualOBJ); # feito! $ SWQOBJ-> ID (); # O ID do objeto SEQWitRality # pode não corresponder ao ID da sequência ou # da qualidade (marque a pod, Lucas) $ SWQOBJ-> SEQ (); # a seqüência do objeto SEQWithQuity $ SWQOBJ-> qual (); # a qualidade do objeto de seqwithquality # para sair partes da sequência. Imprimir "Sequência", $ SEQOBJ-> ID (), "com adesão", $ Seqobj-> Adesão "," e desc ", $ SEQOBJ-> DESC," N "; $ string2 = $ SEQOBJ-> subseq (1,40); Requisitos: · Perl.

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