Bio :: SEQ :: Prinatequal

Bio :: SEQ :: Primário Primário é um módulo bioperl com objeto de qualidade leve.
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Bio :: SEQ :: Prinatequal Classificação e resumo

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  • Chad Matsalla
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Bio :: SEQ :: Prinatequal Descrição

Bio :: Seq :: Primárioqual é um módulo bioperl com objeto de qualidade leve. Bio :: SEQ :: Primárioqual é um módulo bioperl com objeto de qualidade leve.Synopsis Use Bio :: SEQ :: Primário; # Você pode usar uma string delimitada por espaço para qualidade Meu $ string_quals = "102030405040302010"; Meu $ Qualobj = Bio :: Seq :: PrimárioQual-> Novo ('-Qual' => $ String_quals, '-ID' => 'QualityFragment-12', '-Acession_number' => 'x78121' => 'x78121' => 'x78121' => 'x78121' # _or_ Você pode usar uma matriz de valores de qualidade my @ q2 = split / /, $ string_quals; $ QualobJ = Bio :: Seq :: PrimárioQual-> Novo ('-Qual' => @ Q2, '-Preimary_id' => 'chads primarial_id', '-desc' => 'Chads descention' = > 'ChADs Accession_number', '-ID' => 'Chads ID'); # Para obter os valores de qualidade: meus @quals = @ {$ qualobj-> qual ()}; # para dar _New_ valores de qualidade meu $ newqualstring = "5090100020120 0"; $ qualobj-> qual ($ newqualstring); Requisitos: · Perl.


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