Bio :: Popen :: HTSNP

Bio :: Popen :: HTSNP.PM Módulo pode selecionar HTSNP de um conjunto de haplótipo.
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Bio :: Popen :: HTSNP Classificação e resumo

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  • Sendu Bala
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Bio :: Popen :: HTSNP Descrição

Bio :: Popen :: HTSNP.PM Módulo pode selecionar HTSNP de um conjunto de haplótipos. Bio :: Popen :: HTSNP.PM Módulo pode selecionar HTSNP a partir de um conjunto de HaPlotype.Synopsis Use Bio :: Popen :: HTSNP; My $ OBJ = BIO :: HTSNP-> NOVO ($ HAP, $ SNP, $ POP); Selecione o conjunto mínimo de SNP que contém as informações completas sobre o HaPlotype sem redundâncias.Take como entrada os valores seguintes: o bloco haplótipo (matriz de matriz). - O ID SNP (matriz). - Informação da família e frequência (matriz de matriz). O HaPlotype final é gerado em um formato numérico e os conjuntos de SNP podem ser recuperados a partir do módulo.Considerações: - Se você forçar a incluir uma família com indeterminação, o SNP está com indeterminação será removido da análise, então considere antes de colocar sua conjunto de dados O que você realmente quer fazer.- Se duas famílias tiverem as mesmas informações (HaPlotype idênticas), uma delas será removida e os arquivos removidos serão armazenados classificados como removidos. - Apenas são aceitos para cálculo A, C, G, t e - (como deleção) e suas combinações. Qualquer outro valor como n ou? será considerado como degenerações devido à falta de informação. Requisitos: · Perl.


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